선천적 요소
산후 요소인 뇌성마비, 뇌염, 간질 등, 산전 요소인 출산 전, 생후 합병증 등의 산전 산후 요소가 자폐증과 관련 있는 것으로 생각 됩니다.

신경학적 요소
자폐 환자들의 30-70% 정도가 신체 구조의 이상, 병적 반사, 침 흘리기, 바르지 못한 자세, 손의 이상 운동, 정서적 안면마비, 사시 등의 신경학적 이상을 보이며 이는 뇌의 기저핵, 전두엽, 변연계의 기능이 떨어져서 나타나는 증후 입니다.

신경 생리학적 요소
자폐 아동은 뇌의 특정한 피질의 장애로 인해 언어장애를 보이며 의사소통이 힘이 듭니다. 특히 좌반구의 신경 기질이 발달하지 못하는데 원인이 있다고 생각 됩니다.

생화학적 요소
세로토닌, 도파민 등 과 관련 있을 것으로 생각 됩니다.

신경 심리적 요소
자폐아동의 주의력 결핍 증상은 소뇌의 발달이상에 원인이 있고 이는 사회성과 인지 발달에 영향을 끼칩니다.